Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLX4IPQ5VYV7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms