Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU9

C9orf84, Uncharacterized protein C9orf84, humanhuman

Predictions only

Length 1,444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf84Q5VXU9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
C9orf84Q5VXU9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
C9orf84Q5VXU9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
C9orf84Q5VXU9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
C9orf84Q5VXU9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
C9orf84Q5VXU9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
C9orf84Q5VXU9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
C9orf84Q5VXU9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
C9orf84Q5VXU9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC32.22■■■□□ 2.75
C9orf84Q5VXU9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
C9orf84Q5VXU9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
C9orf84Q5VXU9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
C9orf84Q5VXU9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
C9orf84Q5VXU9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
C9orf84Q5VXU9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
C9orf84Q5VXU9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
C9orf84Q5VXU9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
C9orf84Q5VXU9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
C9orf84Q5VXU9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
C9orf84Q5VXU9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
C9orf84Q5VXU9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
C9orf84Q5VXU9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
C9orf84Q5VXU9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
C9orf84Q5VXU9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
C9orf84Q5VXU9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
C9orf84Q5VXU9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC32.19■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
C9orf84Q5VXU9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
C9orf84Q5VXU9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
C9orf84Q5VXU9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms