Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TAF3Q5VWG9 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF3Q5VWG9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms