Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FOCADQ5VW36 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOCADQ5VW36 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms