Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV17

OTUD1, OTU domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD1Q5VV17 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms