Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUG0

SFMBT2, Scm-like with four MBT domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT2Q5VUG0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFMBT2Q5VUG0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFMBT2Q5VUG0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms