Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
STRIP1Q5VSL9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRIP1Q5VSL9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRIP1Q5VSL9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRIP1Q5VSL9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRIP1Q5VSL9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRIP1Q5VSL9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRIP1Q5VSL9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRIP1Q5VSL9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRIP1Q5VSL9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRIP1Q5VSL9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRIP1Q5VSL9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
STRIP1Q5VSL9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRIP1Q5VSL9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRIP1Q5VSL9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRIP1Q5VSL9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRIP1Q5VSL9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRIP1Q5VSL9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRIP1Q5VSL9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRIP1Q5VSL9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRIP1Q5VSL9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRIP1Q5VSL9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRIP1Q5VSL9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRIP1Q5VSL9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRIP1Q5VSL9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRIP1Q5VSL9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRIP1Q5VSL9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRIP1Q5VSL9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRIP1Q5VSL9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRIP1Q5VSL9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRIP1Q5VSL9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRIP1Q5VSL9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRIP1Q5VSL9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRIP1Q5VSL9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRIP1Q5VSL9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRIP1Q5VSL9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRIP1Q5VSL9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRIP1Q5VSL9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRIP1Q5VSL9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRIP1Q5VSL9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRIP1Q5VSL9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRIP1Q5VSL9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRIP1Q5VSL9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRIP1Q5VSL9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRIP1Q5VSL9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRIP1Q5VSL9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRIP1Q5VSL9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRIP1Q5VSL9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
STRIP1Q5VSL9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
STRIP1Q5VSL9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRIP1Q5VSL9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRIP1Q5VSL9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRIP1Q5VSL9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRIP1Q5VSL9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms