Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4T6

SYCP2L, Synaptonemal complex protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2LQ5T4T6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCP2LQ5T4T6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms