Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRH9

TTC39A, Tetratricopeptide repeat protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39AQ5SRH9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC39AQ5SRH9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms