Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQI0

ATAT1, Alpha-tubulin N-acetyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAT1Q5SQI0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATAT1Q5SQI0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATAT1Q5SQI0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATAT1Q5SQI0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATAT1Q5SQI0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATAT1Q5SQI0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATAT1Q5SQI0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATAT1Q5SQI0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATAT1Q5SQI0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATAT1Q5SQI0 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATAT1Q5SQI0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATAT1Q5SQI0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATAT1Q5SQI0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATAT1Q5SQI0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATAT1Q5SQI0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATAT1Q5SQI0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATAT1Q5SQI0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATAT1Q5SQI0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATAT1Q5SQI0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATAT1Q5SQI0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATAT1Q5SQI0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATAT1Q5SQI0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATAT1Q5SQI0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATAT1Q5SQI0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATAT1Q5SQI0 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATAT1Q5SQI0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATAT1Q5SQI0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATAT1Q5SQI0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATAT1Q5SQI0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATAT1Q5SQI0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATAT1Q5SQI0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATAT1Q5SQI0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATAT1Q5SQI0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATAT1Q5SQI0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATAT1Q5SQI0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATAT1Q5SQI0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATAT1Q5SQI0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATAT1Q5SQI0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATAT1Q5SQI0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATAT1Q5SQI0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATAT1Q5SQI0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATAT1Q5SQI0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATAT1Q5SQI0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATAT1Q5SQI0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
ATAT1Q5SQI0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
ATAT1Q5SQI0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATAT1Q5SQI0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATAT1Q5SQI0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATAT1Q5SQI0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATAT1Q5SQI0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATAT1Q5SQI0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms