Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PITRM1Q5JRX3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PITRM1Q5JRX3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PITRM1Q5JRX3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PITRM1Q5JRX3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PITRM1Q5JRX3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PITRM1Q5JRX3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PITRM1Q5JRX3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PITRM1Q5JRX3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PITRM1Q5JRX3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PITRM1Q5JRX3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PITRM1Q5JRX3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PITRM1Q5JRX3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PITRM1Q5JRX3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PITRM1Q5JRX3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PITRM1Q5JRX3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PITRM1Q5JRX3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PITRM1Q5JRX3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PITRM1Q5JRX3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PITRM1Q5JRX3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PITRM1Q5JRX3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PITRM1Q5JRX3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PITRM1Q5JRX3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PITRM1Q5JRX3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PITRM1Q5JRX3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PITRM1Q5JRX3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PITRM1Q5JRX3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PITRM1Q5JRX3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PITRM1Q5JRX3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PITRM1Q5JRX3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PITRM1Q5JRX3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PITRM1Q5JRX3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PITRM1Q5JRX3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PITRM1Q5JRX3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms