Protein–RNA interactions for Protein: Q5C9Z4

NOM1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOM1Q5C9Z4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NOM1Q5C9Z4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOM1Q5C9Z4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOM1Q5C9Z4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOM1Q5C9Z4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOM1Q5C9Z4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NOM1Q5C9Z4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOM1Q5C9Z4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOM1Q5C9Z4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NOM1Q5C9Z4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NOM1Q5C9Z4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NOM1Q5C9Z4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NOM1Q5C9Z4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NOM1Q5C9Z4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NOM1Q5C9Z4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NOM1Q5C9Z4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NOM1Q5C9Z4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NOM1Q5C9Z4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NOM1Q5C9Z4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NOM1Q5C9Z4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NOM1Q5C9Z4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NOM1Q5C9Z4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NOM1Q5C9Z4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NOM1Q5C9Z4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NOM1Q5C9Z4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NOM1Q5C9Z4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NOM1Q5C9Z4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NOM1Q5C9Z4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NOM1Q5C9Z4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NOM1Q5C9Z4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NOM1Q5C9Z4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NOM1Q5C9Z4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NOM1Q5C9Z4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NOM1Q5C9Z4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NOM1Q5C9Z4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NOM1Q5C9Z4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NOM1Q5C9Z4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NOM1Q5C9Z4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NOM1Q5C9Z4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NOM1Q5C9Z4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NOM1Q5C9Z4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NOM1Q5C9Z4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NOM1Q5C9Z4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NOM1Q5C9Z4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NOM1Q5C9Z4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NOM1Q5C9Z4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NOM1Q5C9Z4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NOM1Q5C9Z4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NOM1Q5C9Z4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NOM1Q5C9Z4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NOM1Q5C9Z4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NOM1Q5C9Z4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOM1Q5C9Z4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOM1Q5C9Z4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOM1Q5C9Z4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOM1Q5C9Z4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOM1Q5C9Z4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOM1Q5C9Z4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOM1Q5C9Z4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOM1Q5C9Z4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NOM1Q5C9Z4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOM1Q5C9Z4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOM1Q5C9Z4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOM1Q5C9Z4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOM1Q5C9Z4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOM1Q5C9Z4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOM1Q5C9Z4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOM1Q5C9Z4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOM1Q5C9Z4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
NOM1Q5C9Z4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NOM1Q5C9Z4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms