Protein–RNA interactions for Protein: Q562F6

SGO2, Shugoshin 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO2Q562F6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SGO2Q562F6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms