Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ANKRD39Q53RE8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms