Protein–RNA interactions for Protein: Q53F19

NCBP3, Nuclear cap-binding protein subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP3Q53F19 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
NCBP3Q53F19 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms