Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZHG4

FNDC1, Fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC1Q4ZHG4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNDC1Q4ZHG4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC1Q4ZHG4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms