Protein–RNA interactions for Protein: Q495Y8

SPDYE2, Speedy protein E2, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYE2Q495Y8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPDYE2Q495Y8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPDYE2Q495Y8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPDYE2Q495Y8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPDYE2Q495Y8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPDYE2Q495Y8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPDYE2Q495Y8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPDYE2Q495Y8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPDYE2Q495Y8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPDYE2Q495Y8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPDYE2Q495Y8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPDYE2Q495Y8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPDYE2Q495Y8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPDYE2Q495Y8 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPDYE2Q495Y8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPDYE2Q495Y8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPDYE2Q495Y8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPDYE2Q495Y8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPDYE2Q495Y8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPDYE2Q495Y8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPDYE2Q495Y8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPDYE2Q495Y8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SPDYE2Q495Y8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPDYE2Q495Y8 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SPDYE2Q495Y8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPDYE2Q495Y8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms