Protein–RNA interactions for Protein: Q495D7

LINC01559, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01559, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01559Q495D7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01559Q495D7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms