Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFAP100Q494V2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP100Q494V2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms