Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCT1

ZNF260, Zinc finger protein 260, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF260Q3ZCT1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF260Q3ZCT1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms