Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC96Q2M329 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC96Q2M329 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC96Q2M329 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC96Q2M329 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC96Q2M329 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC96Q2M329 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC96Q2M329 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC96Q2M329 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC96Q2M329 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC96Q2M329 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC96Q2M329 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC96Q2M329 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC96Q2M329 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC96Q2M329 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC96Q2M329 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms