Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR2

RFX7, DNA-binding protein RFX7, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX7Q2KHR2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RFX7Q2KHR2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RFX7Q2KHR2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RFX7Q2KHR2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RFX7Q2KHR2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RFX7Q2KHR2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RFX7Q2KHR2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RFX7Q2KHR2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RFX7Q2KHR2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RFX7Q2KHR2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RFX7Q2KHR2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RFX7Q2KHR2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RFX7Q2KHR2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RFX7Q2KHR2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RFX7Q2KHR2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RFX7Q2KHR2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RFX7Q2KHR2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RFX7Q2KHR2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RFX7Q2KHR2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RFX7Q2KHR2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RFX7Q2KHR2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RFX7Q2KHR2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RFX7Q2KHR2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RFX7Q2KHR2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RFX7Q2KHR2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RFX7Q2KHR2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RFX7Q2KHR2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RFX7Q2KHR2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RFX7Q2KHR2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RFX7Q2KHR2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RFX7Q2KHR2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RFX7Q2KHR2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RFX7Q2KHR2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RFX7Q2KHR2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RFX7Q2KHR2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RFX7Q2KHR2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RFX7Q2KHR2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RFX7Q2KHR2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RFX7Q2KHR2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RFX7Q2KHR2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RFX7Q2KHR2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RFX7Q2KHR2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RFX7Q2KHR2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms