Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q1T7F1 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q1T7F1 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q1T7F1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Q1T7F1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q1T7F1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q1T7F1 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q1T7F1 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q1T7F1 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q1T7F1 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q1T7F1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q1T7F1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q1T7F1 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q1T7F1 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q1T7F1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q1T7F1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q1T7F1 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q1T7F1 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q1T7F1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q1T7F1 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q1T7F1 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Q1T7F1 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q1T7F1 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q1T7F1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q1T7F1 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q1T7F1 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q1T7F1 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q1T7F1 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q1T7F1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q1T7F1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q1T7F1 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q1T7F1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q1T7F1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q1T7F1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q1T7F1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q1T7F1 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q1T7F1 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q1T7F1 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q1T7F1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q1T7F1 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q1T7F1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q1T7F1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q1T7F1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Q1T7F1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q1T7F1 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q1T7F1 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q1T7F1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q1T7F1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q1T7F1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q1T7F1 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Q1T7F1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q1T7F1 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q1T7F1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q1T7F1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q1T7F1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q1T7F1 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q1T7F1 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q1T7F1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q1T7F1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q1T7F1 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q1T7F1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q1T7F1 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q1T7F1 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q1T7F1 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q1T7F1 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q1T7F1 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q1T7F1 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q1T7F1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q1T7F1 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q1T7F1 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q1T7F1 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q1T7F1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q1T7F1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q1T7F1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q1T7F1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q1T7F1 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q1T7F1 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q1T7F1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q1T7F1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q1T7F1 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q1T7F1 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q1T7F1 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q1T7F1 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q1T7F1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q1T7F1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q1T7F1 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q1T7F1 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q1T7F1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q1T7F1 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q1T7F1 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q1T7F1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q1T7F1 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q1T7F1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q1T7F1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q1T7F1 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q1T7F1 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q1T7F1 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q1T7F1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q1T7F1 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q1T7F1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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