Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
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