Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM187BQ17R55 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM187BQ17R55 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM187BQ17R55 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM187BQ17R55 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM187BQ17R55 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM187BQ17R55 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM187BQ17R55 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM187BQ17R55 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM187BQ17R55 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms