Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
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PTPRNQ16849 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRNQ16849 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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