Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPP1Q16831 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UPP1Q16831 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms