Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ECM1Q16610 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ECM1Q16610 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
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