Protein–RNA interactions for Protein: Q16594

TAF9, Transcription initiation factor TFIID subunit 9, humanhuman

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF9Q16594 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TAF9Q16594 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF9Q16594 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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