Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SGCBQ16585 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SGCBQ16585 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
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