Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ACKR1Q16570 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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