Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSRP2Q16527 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSRP2Q16527 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSRP2Q16527 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CSRP2Q16527 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSRP2Q16527 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSRP2Q16527 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSRP2Q16527 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSRP2Q16527 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CSRP2Q16527 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSRP2Q16527 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSRP2Q16527 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSRP2Q16527 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSRP2Q16527 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CSRP2Q16527 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSRP2Q16527 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSRP2Q16527 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSRP2Q16527 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSRP2Q16527 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSRP2Q16527 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSRP2Q16527 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSRP2Q16527 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSRP2Q16527 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSRP2Q16527 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSRP2Q16527 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSRP2Q16527 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSRP2Q16527 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CSRP2Q16527 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSRP2Q16527 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSRP2Q16527 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSRP2Q16527 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSRP2Q16527 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSRP2Q16527 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CSRP2Q16527 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSRP2Q16527 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSRP2Q16527 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CSRP2Q16527 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CSRP2Q16527 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CSRP2Q16527 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSRP2Q16527 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSRP2Q16527 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSRP2Q16527 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSRP2Q16527 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSRP2Q16527 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSRP2Q16527 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSRP2Q16527 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSRP2Q16527 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSRP2Q16527 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSRP2Q16527 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CSRP2Q16527 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSRP2Q16527 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CSRP2Q16527 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSRP2Q16527 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSRP2Q16527 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSRP2Q16527 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSRP2Q16527 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSRP2Q16527 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSRP2Q16527 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSRP2Q16527 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSRP2Q16527 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSRP2Q16527 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSRP2Q16527 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSRP2Q16527 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSRP2Q16527 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSRP2Q16527 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSRP2Q16527 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSRP2Q16527 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSRP2Q16527 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSRP2Q16527 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSRP2Q16527 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSRP2Q16527 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSRP2Q16527 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CSRP2Q16527 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSRP2Q16527 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CSRP2Q16527 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSRP2Q16527 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSRP2Q16527 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSRP2Q16527 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSRP2Q16527 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSRP2Q16527 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSRP2Q16527 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSRP2Q16527 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSRP2Q16527 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSRP2Q16527 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSRP2Q16527 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSRP2Q16527 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSRP2Q16527 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSRP2Q16527 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSRP2Q16527 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSRP2Q16527 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSRP2Q16527 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CSRP2Q16527 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSRP2Q16527 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSRP2Q16527 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSRP2Q16527 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSRP2Q16527 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSRP2Q16527 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSRP2Q16527 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSRP2Q16527 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSRP2Q16527 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms