Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC85BQ15834 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
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