Protein–RNA interactions for Protein: Q15643

TRIP11, Thyroid receptor-interacting protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP11Q15643 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIP11Q15643 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIP11Q15643 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIP11Q15643 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIP11Q15643 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIP11Q15643 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIP11Q15643 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIP11Q15643 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIP11Q15643 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms