Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF1AQ15573 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF1AQ15573 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
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