Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NKX1-1Q15270 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NKX1-1Q15270 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NKX1-1Q15270 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NKX1-1Q15270 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NKX1-1Q15270 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
NKX1-1Q15270 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NKX1-1Q15270 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NKX1-1Q15270 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NKX1-1Q15270 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NKX1-1Q15270 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NKX1-1Q15270 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NKX1-1Q15270 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
NKX1-1Q15270 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NKX1-1Q15270 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NKX1-1Q15270 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NKX1-1Q15270 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NKX1-1Q15270 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NKX1-1Q15270 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NKX1-1Q15270 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NKX1-1Q15270 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NKX1-1Q15270 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NKX1-1Q15270 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NKX1-1Q15270 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NKX1-1Q15270 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NKX1-1Q15270 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NKX1-1Q15270 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NKX1-1Q15270 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms