Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
RAB3GAP1Q15042 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RAB3GAP1Q15042 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
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