Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HERC3Q15034 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
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