Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
R3HDM1Q15032 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
R3HDM1Q15032 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
R3HDM1Q15032 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
R3HDM1Q15032 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
R3HDM1Q15032 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
R3HDM1Q15032 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
R3HDM1Q15032 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
R3HDM1Q15032 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
R3HDM1Q15032 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
R3HDM1Q15032 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
R3HDM1Q15032 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
R3HDM1Q15032 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
R3HDM1Q15032 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
R3HDM1Q15032 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
R3HDM1Q15032 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
R3HDM1Q15032 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
R3HDM1Q15032 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
R3HDM1Q15032 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
R3HDM1Q15032 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
R3HDM1Q15032 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
R3HDM1Q15032 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
R3HDM1Q15032 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
R3HDM1Q15032 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
R3HDM1Q15032 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
R3HDM1Q15032 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
R3HDM1Q15032 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
R3HDM1Q15032 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
R3HDM1Q15032 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
R3HDM1Q15032 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
R3HDM1Q15032 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
R3HDM1Q15032 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
R3HDM1Q15032 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
R3HDM1Q15032 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
R3HDM1Q15032 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
R3HDM1Q15032 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
R3HDM1Q15032 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
R3HDM1Q15032 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
R3HDM1Q15032 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
R3HDM1Q15032 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
R3HDM1Q15032 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
R3HDM1Q15032 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
R3HDM1Q15032 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
R3HDM1Q15032 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
R3HDM1Q15032 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
R3HDM1Q15032 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
R3HDM1Q15032 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
R3HDM1Q15032 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
R3HDM1Q15032 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
R3HDM1Q15032 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
R3HDM1Q15032 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
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