Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SHPRHQ149N8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SHPRHQ149N8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SHPRHQ149N8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SHPRHQ149N8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SHPRHQ149N8 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SHPRHQ149N8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SHPRHQ149N8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SHPRHQ149N8 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SHPRHQ149N8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SHPRHQ149N8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SHPRHQ149N8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SHPRHQ149N8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SHPRHQ149N8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SHPRHQ149N8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SHPRHQ149N8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SHPRHQ149N8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SHPRHQ149N8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SHPRHQ149N8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SHPRHQ149N8 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SHPRHQ149N8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SHPRHQ149N8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SHPRHQ149N8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
SHPRHQ149N8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SHPRHQ149N8 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SHPRHQ149N8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
SHPRHQ149N8 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SHPRHQ149N8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SHPRHQ149N8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SHPRHQ149N8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SHPRHQ149N8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SHPRHQ149N8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SHPRHQ149N8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SHPRHQ149N8 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SHPRHQ149N8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SHPRHQ149N8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SHPRHQ149N8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SHPRHQ149N8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SHPRHQ149N8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SHPRHQ149N8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SHPRHQ149N8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SHPRHQ149N8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SHPRHQ149N8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SHPRHQ149N8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SHPRHQ149N8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SHPRHQ149N8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SHPRHQ149N8 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
SHPRHQ149N8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SHPRHQ149N8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SHPRHQ149N8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SHPRHQ149N8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SHPRHQ149N8 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SHPRHQ149N8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SHPRHQ149N8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SHPRHQ149N8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SHPRHQ149N8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SHPRHQ149N8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SHPRHQ149N8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SHPRHQ149N8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SHPRHQ149N8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SHPRHQ149N8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SHPRHQ149N8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SHPRHQ149N8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SHPRHQ149N8 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SHPRHQ149N8 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SHPRHQ149N8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SHPRHQ149N8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SHPRHQ149N8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SHPRHQ149N8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SHPRHQ149N8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SHPRHQ149N8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SHPRHQ149N8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SHPRHQ149N8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SHPRHQ149N8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SHPRHQ149N8 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SHPRHQ149N8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SHPRHQ149N8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SHPRHQ149N8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SHPRHQ149N8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SHPRHQ149N8 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SHPRHQ149N8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SHPRHQ149N8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SHPRHQ149N8 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SHPRHQ149N8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SHPRHQ149N8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SHPRHQ149N8 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SHPRHQ149N8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SHPRHQ149N8 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SHPRHQ149N8 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SHPRHQ149N8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SHPRHQ149N8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SHPRHQ149N8 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SHPRHQ149N8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SHPRHQ149N8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SHPRHQ149N8 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SHPRHQ149N8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SHPRHQ149N8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SHPRHQ149N8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SHPRHQ149N8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SHPRHQ149N8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
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