Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MDC1Q14676 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MDC1Q14676 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MDC1Q14676 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MDC1Q14676 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MDC1Q14676 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MDC1Q14676 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
MDC1Q14676 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
MDC1Q14676 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MDC1Q14676 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
MDC1Q14676 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MDC1Q14676 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MDC1Q14676 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MDC1Q14676 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MDC1Q14676 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MDC1Q14676 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MDC1Q14676 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MDC1Q14676 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MDC1Q14676 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MDC1Q14676 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MDC1Q14676 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MDC1Q14676 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
MDC1Q14676 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MDC1Q14676 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MDC1Q14676 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MDC1Q14676 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MDC1Q14676 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MDC1Q14676 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MDC1Q14676 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MDC1Q14676 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MDC1Q14676 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MDC1Q14676 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MDC1Q14676 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MDC1Q14676 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MDC1Q14676 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MDC1Q14676 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MDC1Q14676 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MDC1Q14676 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MDC1Q14676 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MDC1Q14676 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MDC1Q14676 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MDC1Q14676 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MDC1Q14676 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MDC1Q14676 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MDC1Q14676 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MDC1Q14676 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MDC1Q14676 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MDC1Q14676 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MDC1Q14676 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MDC1Q14676 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MDC1Q14676 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MDC1Q14676 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
MDC1Q14676 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MDC1Q14676 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MDC1Q14676 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MDC1Q14676 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MDC1Q14676 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MDC1Q14676 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MDC1Q14676 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MDC1Q14676 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MDC1Q14676 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MDC1Q14676 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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