Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEMA3AQ14563 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA3AQ14563 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms