Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEDD9Q14511 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
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