Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBE4AQ14139 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
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