Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
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COL4A6Q14031 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
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COL4A6Q14031 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
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COL4A6Q14031 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
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COL4A6Q14031 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A6Q14031 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A6Q14031 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
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