Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CIRBPQ14011 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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