Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CDK13Q14004 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CDK13Q14004 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CDK13Q14004 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CDK13Q14004 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
CDK13Q14004 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CDK13Q14004 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CDK13Q14004 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CDK13Q14004 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CDK13Q14004 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CDK13Q14004 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CDK13Q14004 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CDK13Q14004 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CDK13Q14004 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
CDK13Q14004 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
CDK13Q14004 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CDK13Q14004 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CDK13Q14004 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CDK13Q14004 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CDK13Q14004 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
CDK13Q14004 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CDK13Q14004 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CDK13Q14004 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CDK13Q14004 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CDK13Q14004 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CDK13Q14004 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CDK13Q14004 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CDK13Q14004 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CDK13Q14004 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CDK13Q14004 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CDK13Q14004 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CDK13Q14004 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CDK13Q14004 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CDK13Q14004 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CDK13Q14004 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CDK13Q14004 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
CDK13Q14004 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CDK13Q14004 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CDK13Q14004 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
CDK13Q14004 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CDK13Q14004 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CDK13Q14004 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CDK13Q14004 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CDK13Q14004 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CDK13Q14004 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CDK13Q14004 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CDK13Q14004 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CDK13Q14004 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CDK13Q14004 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CDK13Q14004 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CDK13Q14004 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CDK13Q14004 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CDK13Q14004 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CDK13Q14004 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CDK13Q14004 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CDK13Q14004 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CDK13Q14004 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CDK13Q14004 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CDK13Q14004 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CDK13Q14004 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CDK13Q14004 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
CDK13Q14004 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CDK13Q14004 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CDK13Q14004 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CDK13Q14004 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC33.07■■■□□ 2.89
CDK13Q14004 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.89
CDK13Q14004 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.89
CDK13Q14004 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
CDK13Q14004 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
CDK13Q14004 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.89
CDK13Q14004 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CDK13Q14004 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CDK13Q14004 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CDK13Q14004 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CDK13Q14004 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CDK13Q14004 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CDK13Q14004 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CDK13Q14004 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CDK13Q14004 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CDK13Q14004 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CDK13Q14004 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CDK13Q14004 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CDK13Q14004 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CDK13Q14004 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CDK13Q14004 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CDK13Q14004 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CDK13Q14004 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CDK13Q14004 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CDK13Q14004 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CDK13Q14004 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CDK13Q14004 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CDK13Q14004 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CDK13Q14004 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CDK13Q14004 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CDK13Q14004 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CDK13Q14004 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CDK13Q14004 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
CDK13Q14004 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CDK13Q14004 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CDK13Q14004 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
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