Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCINQ13939 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCINQ13939 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCINQ13939 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCINQ13939 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCINQ13939 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCINQ13939 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCINQ13939 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCINQ13939 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCINQ13939 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCINQ13939 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCINQ13939 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCINQ13939 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCINQ13939 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCINQ13939 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCINQ13939 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCINQ13939 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCINQ13939 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCINQ13939 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCINQ13939 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCINQ13939 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCINQ13939 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCINQ13939 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCINQ13939 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCINQ13939 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCINQ13939 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCINQ13939 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCINQ13939 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCINQ13939 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCINQ13939 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCINQ13939 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCINQ13939 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCINQ13939 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCINQ13939 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCINQ13939 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCINQ13939 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCINQ13939 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCINQ13939 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCINQ13939 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCINQ13939 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCINQ13939 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCINQ13939 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCINQ13939 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCINQ13939 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCINQ13939 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCINQ13939 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCINQ13939 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCINQ13939 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCINQ13939 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCINQ13939 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCINQ13939 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCINQ13939 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCINQ13939 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCINQ13939 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCINQ13939 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCINQ13939 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCINQ13939 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCINQ13939 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCINQ13939 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCINQ13939 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCINQ13939 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCINQ13939 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCINQ13939 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCINQ13939 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCINQ13939 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCINQ13939 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCINQ13939 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCINQ13939 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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CCINQ13939 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCINQ13939 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCINQ13939 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCINQ13939 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCINQ13939 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCINQ13939 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCINQ13939 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCINQ13939 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCINQ13939 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCINQ13939 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCINQ13939 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCINQ13939 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCINQ13939 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCINQ13939 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCINQ13939 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCINQ13939 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCINQ13939 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCINQ13939 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCINQ13939 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCINQ13939 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCINQ13939 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCINQ13939 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCINQ13939 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCINQ13939 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCINQ13939 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCINQ13939 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCINQ13939 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCINQ13939 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCINQ13939 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCINQ13939 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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