Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SNTB1Q13884 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNTB1Q13884 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms