Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HTR4Q13639 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HTR4Q13639 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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